Ни для кого не секрет, что если включён compiz, то курсор мыши будет меняться так, как хочется ему, а не вам. Если просто распаковать курсоры в ~/.icons и выбрать курсор во "Внешний вид", то в половине приложений курсор будет старый.

Есть более правильный способ установки курсора:
1. Скачайте понравившийся курсор отсюда: http://gnome-look.org/.
2. Через Midnight Commander из-под rootа распакуйте тему курсора в /usr/share/icons.
3. Зайдите через mc в папку /usr/share/icons/default. Там будет файл index.theme. В нем после знака = напишите (редактирование - F4) имя папки с курсором, которую мы распаковали в /usr/share/icons.
Обязательно соблюдайте регистр (т.е. большие и маленькие буквы).
4. Сохраните index.theme клавишей F2 и перезагрузите систему. После загрузки во всех приложениях будет отображаться нужный нам курсор.